De Zwolse Werkafspraken worden gemaakt door een werkgroep bestaande uit huisartsen en specialisten. Vaak wordt er commentaar gevraagd en geleverd door ziekenhuisapothekers en openbare apothekers. Ook worden eventueel andere specialisten en andere instellingen (GGZ, thuiszorg) om commentaar gevraagd. De specialisten spreken namens hun maatschappen.

De Werkafspraken worden in gedrukte versie rondgestuurd naar allen in de regio waarvan verwacht wordt dat zij belangstelling hiervoor hebben. Soms zijn kleine wijzigingen geen reden voor herdruk maar wel voor aanpassing op de website-editie (herkenbaar in de kop door (ws) bij vermelding van de druk).

Veel Werkafspraken zijn of worden aan huisartsen gepresenteerd via de Interline systematiek.